کاربردهای لیزر را می‌توان در دو بخش لیزرهای جراحی و ترمیمی طبقه‌بندی كرد. در جراحیهای لیزری، لیزر به عنوان چاقویی بسیار ظریف و حساس استفاده می‌شود. لیزر ترمیمی با اثرات ضد درد، ضد التهاب و سرعت‌بخشی در ترمیم ضایعات و زخم‌ها یك درمان كاملا بدون عارضه است. لیزر چشم پزشكی، در درمان بیماری‌های شبكیه، جراحیهای جسم مژگانی، اصلاح عیوب انكساری، جراحی ترمیمی پلك کاربرد وسیعی دارد. از دیگر موارد پر استفاده لیزر می توان به کاربرد لیزر در جوانسازی پوست و زیبایی و رفع موهای زائد اشاره نمود. لیزر در درمان بیماری‌های زنان و زایمان، درمان دردهای مزمن لگنی، عفونت‌ها و زخم‌های واژینال و دردرمان بیماری‌های داخلی مانند بیماری‌های گوارشی مانند زخم معده، سندرم روده تحریك‌پذیر، یبوست کاربردی وسیع پیدا نموده است. درمان بیماری‌های گوش و حلق و بینی مانند سینوزیت، ، عفونت‌های گوش میانی، پارگی پرده گوش و درمان زخم‌های حاد و مزمن از دیگر موارد استفاده از لیزر توسط پزشکان می باشد.